Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Derl3Q9D8K3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Derl3Q9D8K3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms