Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Zcchc13Q9D548 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms