Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Syce1Q9D495 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syce1Q9D495 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms