Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Acer3Q9D099 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Acer3Q9D099 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Acer3Q9D099 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Acer3Q9D099 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Acer3Q9D099 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acer3Q9D099 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Acer3Q9D099 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acer3Q9D099 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acer3Q9D099 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acer3Q9D099 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acer3Q9D099 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Acer3Q9D099 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Acer3Q9D099 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms