Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Shisa9Q9CZN4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms