Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RpainQ9CWY9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RpainQ9CWY9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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