Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MINDY3Q9CV28 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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