Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tgs1Q923W1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tgs1Q923W1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms