Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubb6Q922F4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms