Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hps3Q91VB4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hps3Q91VB4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms