Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF248Q8NDW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF248Q8NDW4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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