Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms