Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna3Q65CL1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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