Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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