Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm29609Q3UU56 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm29609Q3UU56 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm29609Q3UU56 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm29609Q3UU56 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm29609Q3UU56 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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