Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nom1Q3UFM5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms