Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim71Q1PSW8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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