Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Siah1bQ06985 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms