Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox12Q04890 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms