Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SgcdP82347 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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