Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rph3aP47708 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rph3aP47708 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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