Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timp3P39876 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms