Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab5cP35278 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab5cP35278 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab5cP35278 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rab5cP35278 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rab5cP35278 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rab5cP35278 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5cP35278 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5cP35278 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5cP35278 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5cP35278 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rab5cP35278 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab5cP35278 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rab5cP35278 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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