Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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PdgfraP26618 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PdgfraP26618 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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