Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CftrP26361 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CftrP26361 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CftrP26361 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CftrP26361 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CftrP26361 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CftrP26361 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CftrP26361 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CftrP26361 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CftrP26361 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CftrP26361 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CftrP26361 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CftrP26361 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms