Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Fcer1aP20489 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms