Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Becn2P0DM65 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Becn2P0DM65 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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