Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ccl20O89093 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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