Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms