Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3278L7N2D2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms