Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm20939L7N243 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm20939L7N243 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm20939L7N243 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm20939L7N243 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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