Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Zfp616J3QN14 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Zfp616J3QN14 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms