Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms