Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms