Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm6880A3KG45 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Gm6880A3KG45 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Gm6880A3KG45 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms