Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GabreA2AMW3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GabreA2AMW3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms