Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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