Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer3W4VSP1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Speer3W4VSP1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Speer3W4VSP1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Speer3W4VSP1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms