Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpl9-ps1S4R1R7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpl9-ps1S4R1R7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl9-ps1S4R1R7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl9-ps1S4R1R7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms