Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpne6Q9Z140 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cpne6Q9Z140 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne6Q9Z140 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms