Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTZ1

Rnf7, RING-box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf7Q9WTZ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnf7Q9WTZ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf7Q9WTZ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf7Q9WTZ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms