Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdcd7Q9WTY1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd7Q9WTY1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdcd7Q9WTY1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd7Q9WTY1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd7Q9WTY1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd7Q9WTY1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd7Q9WTY1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd7Q9WTY1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd7Q9WTY1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd7Q9WTY1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd7Q9WTY1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd7Q9WTY1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms