Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cul1Q9WTX6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cul1Q9WTX6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul1Q9WTX6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms