Protein–RNA interactions for Protein: Q9R210

Tfeb, Transcription factor EB, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfebQ9R210 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TfebQ9R210 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TfebQ9R210 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TfebQ9R210 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TfebQ9R210 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms