Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmed2Q9R0Q3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmed2Q9R0Q3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed2Q9R0Q3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms