Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp11cQ9QZW0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp11cQ9QZW0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp11cQ9QZW0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp11cQ9QZW0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms