Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp21Q9QZL6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp21Q9QZL6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp21Q9QZL6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp21Q9QZL6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms