Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ripk3Q9QZL0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ripk3Q9QZL0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ripk3Q9QZL0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ripk3Q9QZL0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ripk3Q9QZL0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms