Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hacd1Q9QY80 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hacd1Q9QY80 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hacd1Q9QY80 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms