Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Abcb11Q9QY30 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Abcb11Q9QY30 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Abcb11Q9QY30 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb11Q9QY30 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms